Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thsd4Q3UTY6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Thsd4Q3UTY6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms