Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp560Q3URI6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp560Q3URI6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms