Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf3Q3UPW2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf3Q3UPW2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms