Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms