Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrch2Q3UMG5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms