Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc34Q3UI66 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms