Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms