Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pid1Q3UBG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms