Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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