Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk3Q3U3Q1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms