Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gse1Q3U3C9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms