Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pag1Q3U1F9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms