Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U1D9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms