Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms