Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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