Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms