Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc136Q3TVA9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms