Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTJ4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms