Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130409I23RikQ3TS87 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130409I23RikQ3TS87 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms