Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms