Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XylbQ3TNA1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XylbQ3TNA1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms