Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms