Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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