Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2afvQ3THW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afvQ3THW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms