Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2f1Q3THK3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms