Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc127Q3TC33 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms