Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms