Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms