Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam178bQ24JP3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms