Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myo3bQ1EG27 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myo3bQ1EG27 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms