Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms