Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klrb1Q0ZUP1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klrb1Q0ZUP1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms