Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli2Q0VGT2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms