Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc39dQ0VF76 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc39dQ0VF76 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms