Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms