Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc1Q0VDN7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms