Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Itgb8Q0VBD0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb8Q0VBD0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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