Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab42Q0PD08 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms