Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps8Q0P5W1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps8Q0P5W1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms