Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms