Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc21bQ0HA38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc21bQ0HA38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms