Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q08AU9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q08AU9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms