Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MitfQ08874 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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