Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col9a2Q07643 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms