Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NrepQ07475 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NrepQ07475 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms