Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms