Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox4Q06831 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms