Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdr16c6Q05A13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms