Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprgQ05909 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms