Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox8Q04886 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms